2020/02/09 2018/12/27 用語「tarファイル」の説明です。正確ではないけど何となく分かる、IT用語の意味を「ざっくりと」理解するためのIT用語辞典です。専門外の方でも理解しやすいように、初心者が分かりやすい表現を使うように心がけています。 CentOS7でファイルをダウンロードして解凍するコマンドのメモ 投稿日：2017年01月20日 最終更新日： 2017年10月26日 このページはCentOS7において、圧縮されたファイルをダウンロード→解凍するコマンドのメモ書きです。 もくじ ファイルダウンロード 2020/07/13
特に私の場合はBamToolsでBEDからBAMへ変換したファイルを利用したため、 カラースペースタグなどの情報が欠落しているためと思われます。 無視して、実行するには、VALIDATION_STRINGENCYオプションをSILENTにしてやります。
2012/12/22 随時更新 2019 1/23 リンク修正 2020 4/17 samtoolsについてmultiqcと連携する例を追記 2020 4/18 help更新、インストール方法追加 samとbamのハンドリングに関するツールを紹介する。 追記 --2017-- 8/20 samblaster samblasterでduplicationリードにタグをつける 8/29 BBTools 其の1、其の2 9/27 bamに塩基置換やindel変異を起こす .tar.gzなのでtar zxvfで解凍。-Cで解凍先を指定する。 tar zxvf bedtools-2.19.1.tar.gz -C ../local/ localのbedtools-2.19.1に移動してREADME.mdをみてもインストールに関する事が書いていない。のでここにあるマニュアルをダウンロードしてみるとinstallという項目がある。 著作権ファイル; Debian パッチ追跡システム; bamtools ソースパッケージをダウンロード: [bamtools_2.5.1+dfsg-7.dsc] [bamtools_2.5.1+dfsg.orig.tar.gz] [bamtools_2.5.1+dfsg-7.debian.tar.xz] メンテナ: Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ) Michael R. Crusoe (QA ページ) Andreas Tille (QA samtools で sam/bam ファイルを操作する. samファイルはシーケンスリードがゲノムのどの位置にあるかを記述するファイル形式であり、様々なシーケンス解析のツールで利用されている。
2017/05/23
2014/09/01 tarコマンドとは？ 「tar」は、複数のファイルを1つにまとめた“アーカイブファイル”を作成／展開するコマンドです。 アーカイブとは 2019/06/28 2018/11/07 本稿では Linux のコマンドで、WEB上のファイルをダウンロードする方法について解説します。Linux のコマンドでファイルをダウンロードするのに頻繁に利用されるコマンドは、wget コマンドと curl コマンドがあります。 本稿では、それぞれのコマンドについて解説します。 ダウンロードしたメッセージやファイルは、.tar ファイルとしてダウンロードされます。 .tar 形式のエクスポート ファイルを開きメッセージやファイルを抽出するには、別のアプリケーションが必要な場合があります。 Windows 10 で .tar ファイルを抽出
.tar.gzなのでtar zxvfで解凍。-Cで解凍先を指定する。 tar zxvf bedtools-2.19.1.tar.gz -C ../local/ localのbedtools-2.19.1に移動してREADME.mdをみてもインストールに関する事が書いていない。のでここにあるマニュアルをダウンロードしてみるとinstallという項目がある。
用語「tarファイル」の説明です。正確ではないけど何となく分かる、IT用語の意味を「ざっくりと」理解するためのIT用語辞典です。専門外の方でも理解しやすいように、初心者が分かりやすい表現を使うように心がけています。 CentOS7でファイルをダウンロードして解凍するコマンドのメモ 投稿日：2017年01月20日 最終更新日： 2017年10月26日 このページはCentOS7において、圧縮されたファイルをダウンロード→解凍するコマンドのメモ書きです。 もくじ ファイルダウンロード 2020/07/13 2020/05/27 ウィンドウズ10ではZIPなどは標準的に圧縮ファイルを解凍できます。 しかしtarやgzなどのファイルの場合は、専用ソフトが必要です。 無料でつかえるものもあるので利用してみるとよいでしょう。 tarやgzとは？解凍するには？ 9 Zipの使い方 解凍 圧縮 感想は？ 2018/11/23 2017/06/19
インターネット上のあるサイトから、*.tar.gzという拡張子のファイルをインターネットエクスプローラーからダウンロードしようすると、ファイル保存のダイアログで「*.tar.tar」というファイル名になってしまいます。ダウンロードの際、 nkf Network Kanji Filter プロジェクト の nkf207.tar.gz の無料ダウンロードページ。ものすごく古い漢字コード変換プログラムであるnkfを、 メンテナンスするプロジェクトです。 2018年11月23日 それで、MediaWikiのダウンロードページにいくと、ファイル形式は .tar.gz のようだ。 7.zipで解凍できる様子だが、ほかにも解凍手段あるだろうと思ったので調べた。 以下は解凍手段に 2015年8月25日 wget http://downloads.sourceforge.net/project/pyml/PyML-0.7.13.3.tar.gz $ tar zxf PyML-0.7.13.3.tar.gz $ cd -j 8 && sudo make install 安装bamtools $ wget https://github.com/pezmaster31/bamtools/archive/master.zip -O 2018年2月11日 tarはUnix系オペレーティングシステムで使われていたファイルアーカイブコマンドで、Linuxディストリビューションにも含まれている。 curlは、たとえばインターネット上のダウンロードURLなどのアクセスに利用してウェブブラウザを開くことなく
大量にあるファイルを一つずつFTPクライアントで落しても良いのですが、ものすごく時間が掛かる上、途中で止まってしまうこともあります。それならば、.tar で一塊にしてからダウンロードしたいと思うところです。 その方が、効率的ですしね。
[解決方法が見つかりました！] PPAを使用するか、自分でコンパイルします。 PPAによるインストール（3.2へのアップグレード） sudo apt-get install software-properties-common sudo add-apt-repository ppa:george-edison55/cmake-3.x sudo apt-get update cmakeがまだインストールされていない場合： sudo apt-get install